Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul4bA2A432 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cul4bA2A432 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul4bA2A432 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul4bA2A432 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul4bA2A432 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cul4bA2A432 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul4bA2A432 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms