Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms