Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRV1

Vmn1r82, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r82A0A087WRV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r82A0A087WRV1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r82A0A087WRV1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r82A0A087WRV1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r82A0A087WRV1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r82A0A087WRV1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r82A0A087WRV1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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