Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm17087V9GXQ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm17087V9GXQ2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm17087V9GXQ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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