Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Gpc1Q9QZF2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc1Q9QZF2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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