Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bgrlQ9JJU8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrlQ9JJU8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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