Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Subh2bvQ9D9Z7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms