Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gadd45gip1Q9CR59 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gadd45gip1Q9CR59 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gadd45gip1Q9CR59 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gadd45gip1Q9CR59 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gadd45gip1Q9CR59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gadd45gip1Q9CR59 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gadd45gip1Q9CR59 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms