Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB7

Rnf141, RING finger protein 141, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf141Q99MB7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf141Q99MB7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf141Q99MB7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137 ms