Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mre11Q61216 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mre11Q61216 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms