Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms