Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkain3Q3URJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkain3Q3URJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms