Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VldlrP98156 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VldlrP98156 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VldlrP98156 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms