Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Kif3aP28741 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3aP28741 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif3aP28741 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif3aP28741 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif3aP28741 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif3aP28741 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif3aP28741 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms