Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtmaP26350 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtmaP26350 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtmaP26350 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms