Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf1aP25118 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf1aP25118 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms