Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rabep1O35551 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rabep1O35551 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms