Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r194J3JS27 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r194J3JS27 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.3 ms