Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm8247F6VRJ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8247F6VRJ8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms