Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
2610001J05RikF2Z3Y9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2610001J05RikF2Z3Y9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms