Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms