Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdc27A2A6Q5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdc27A2A6Q5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdc27A2A6Q5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms