Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited4Q9WUL8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 822 ms