Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spns3Q9D232 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spns3Q9D232 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms