Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan11Q9D1D1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms