Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lrrn2Q6PHP6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Lrrn2Q6PHP6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Lrrn2Q6PHP6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn2Q6PHP6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms