Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med16Q6PGF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med16Q6PGF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms