Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zic3Q62521 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zic3Q62521 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms