Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930567H17RikQ3V0K5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930567H17RikQ3V0K5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms