Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms