Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ulk3Q3U3Q1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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