Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bop1P97452 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bop1P97452 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bop1P97452 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bop1P97452 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms