Protein–RNA interactions for Protein: P70670

Naca, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacaP70670 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NacaP70670 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NacaP70670 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NacaP70670 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NacaP70670 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NacaP70670 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NacaP70670 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NacaP70670 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NacaP70670 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NacaP70670 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NacaP70670 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NacaP70670 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NacaP70670 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NacaP70670 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms