Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa11P50709 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms