Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sox2P48432 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sox2P48432 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms