Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Catsperg2C6KI89 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Catsperg2C6KI89 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms