Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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