Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn19Q9ET38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms