Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tlr1Q9EPQ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tlr1Q9EPQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tlr1Q9EPQ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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