Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rsph3bQ9DA80 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rsph3bQ9DA80 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms