Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4933402E13RikQ9D4D2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933402E13RikQ9D4D2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms