Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx15Q91WE1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx15Q91WE1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx15Q91WE1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx15Q91WE1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx15Q91WE1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx15Q91WE1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx15Q91WE1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms