Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q7

Brox, BRO1 domain-containing protein BROX, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BroxQ8K2Q7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BroxQ8K2Q7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BroxQ8K2Q7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms