Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pdcl3Q8BVF2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms