Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnot1Q6ZQ08 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cnot1Q6ZQ08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms