Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms