Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
5730522E02RikQ5SP45 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5730522E02RikQ5SP45 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms