Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SfswapQ3USH5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SfswapQ3USH5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms