Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmod2Q3UHZ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmod2Q3UHZ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmod2Q3UHZ5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms