Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp444Q3TDV8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp444Q3TDV8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms